蛋白質のアミノ酸配列または核酸の塩基配列を互いに比較し相同性を明らかにするためのグラフである。考案者Robert Harrにちなみハー・プロット(Harr plot)とも呼ばれる。縦軸(上から下へ)および横軸(左から右へ)に各配列をとり、一致した点にプロットする。すると同じ配列がある部分には線が現れるため、相同性を直感的に確認することができる。